A nagyköveti szintű diplomáciai kapcsolatokat 1965 novemberében vettük fel.
1972-től, Zulfikar Ali Bhutto hatalomra jutását követően kapcsolataink megélénkültek. Bhutto polgári kormányának 1977-es megdöntése, a volt miniszterelnök kivégzése, Zia ul Haq katonai diktatúrája, az iszlám fundamentalizmust támogató politikája miatt a 80-as években magas szintű politikai kontaktusokra csak szórványosan került sor.
A polgári kormányzás 1988. évi helyreállítása Pakisztánban, majd a magyarországi rendszerváltozás új perspektívát nyitott kapcsolatainkban, melyet a két parlament vezetőinek látogatásai reprezentáltak. A magyar-pakisztáni kapcsolatok az 1999 októberében történt iszlámábádi katonai hatalomátvétel következtében visszaestek, azonban a 2000-es évek első évtizedének közepére politikai és gazdasági együttműködésünk bővült.
A 2008-as pakisztáni választások nyomán kibontakozó demokratizálódási folyamat jelentős perspektívákat kínált a kétoldalú együttműködés bővítésére is, azonban az ezzel egyidőben, 2008-09-től látványosan romló pakisztáni belső biztonsági környezet és a terrorista tevékenység immár a fővárost is elért terjedése ismételten kedvezőtlenül hatott kapcsolatépítési törekvéseinkre. A nehézségek ellenére törekszünk az egyébként komoly tartalékokkal rendelkező politikai, gazdasági és lehetőség szerint kulturális kapcsolataink fokozatos kiterjesztésére.