匈牙利政府和中华人民共和国政府就科学和技术的合作协议于2002年签署。为了落实协议的条款，建立了科技合作混委会，由双方指派的政府代表和专家组成。混委会成员每两年开一次会，最后一次会议于2010年在布达佩斯举行。双边科技合作目前的优先领域包括：自然，医疗，生命，工程，农业以及环境科学。匈牙利还在学术、大学和企业层面与中国保持着卓有成效的双边合作。总的目标是加强两国间的科技合作并寻求更多的合作方式达成这一目标。