1918 novemberében, az Osztrák-Magyar Monarchia széthullásával megszűnt a közel négyszáz éves közös állami keret. Az I. világháborút lezáró békeszerződések alapján három nyugat-magyarországi vármegye (Moson, Sopron, Vas) nyugati – jobbára német ajkú – felét Ausztriához csatolták, melyből 1921-ben Burgenland néven új osztrák tartományt hoztak létre. A magyar-osztrák diplomáciai kapcsolatok követi szintű felvételére még 1918 őszén, majd a II. világháború utáni újrafelvételére 1947. március 14-én került sor. A kapcsolatokat 1964. november elsején emeltük nagyköveti szintre.
A rendszerváltozást követően az alábbi nagykövetek képviselték Magyarországot Ausztriában: Hunkár Dénes, Peisch Sándor, Barsiné Pataky Etelka, Horváth István. A jelenlegi nagykövet, Szalay-Bobrovniczky Vince 2010. december 9-én adta át megbízólevelét Heinz Fischer osztrák államfőnek.

A két ország vezetése között rendszeres a párbeszéd. Schmitt Pál köztársasági elnök a megválasztását követő első külföldi látogatását 2010. szeptember 7-én Bécsben tette. Orbán Viktor miniszterelnök 2010. december 14-én ugyancsak Bécsben találkozott Faymann kancellárral a magyar EU-elnökség előkészítése jegyében. Martonyi János külügyminiszter rendszeresen eleget tesz ausztriai hivatalos és informális jellegű meghívásoknak. Folyamatos a kapcsolattartás a szaktárcák között is. A határmenti régió határon átívelő együttműködésének a központi kormányok részvételével működő Regionális Koordinációs Fórum ad politikai keretet. Az elmúlt években néhány zavaró jelenség – pl. határutak, Rába-habzás, heiligenkreuzi hulladék-égető - időről-időre vitát gerjesztett kapcsolatainkban.