A két ország kulturális együttműködésének keretét az "Osztrák Köztársaság és a Magyar Köztársaság Vegyes Bizottságának Osztrák-Magyar Kulturális és Tudományos Együttműködési Egyezménye" képezi, melyet 1976. május 19-e óta háromévenként újítanak meg, és rögzítenek, az ún. Jegyzőkönyvben. A munkaterv a kulturális együttműködés keretében szorgalmazza többek között a kulturális intézmények közötti közvetlen kapcsolatfelvételt, művészek, írók, szakértők cseréjét, színházi együttesek közvetlen kapcsolatait, kortárs művészeti kiállítások rendezését. A kétoldalú oktatási kapcsolatokat, a magyar tanszék, illetve a lektori és vendégtanári rendszert szintén a munkaprogram szabályozza. A Bécsi Egyetem Finnugrisztikai Tanszéke 1974 óta létezik és folytat hungarológiai oktatást/kutatást. Magyarországon a szegedi egyetemnek van osztrák tanszéke.A 2001-ben alapított Budapesti Andrássy Gyula Német nyelvű Egyetem működtetésében az osztrák kormány is részt vesz. A kétoldalú hallgatói és kutatói cserét ösztöndíjas pályázati lehetőségekkel szolgálja az Osztrák-Magyar Tudományos és Oktatási Kooperációs Akcióprogram Alapítvány. A magánalapítású grazi Stipendium Hungaricum fiatal magyar zenei tehetségek grazi képzését segíti.A két ország szorosan együttműködött a 2009-es Haydn-, illetve a 2011-es Liszt-emlékév programjainak előkészítésében. Linz és Pécs városa között együttműködés jött létre a 2009. és 2010. évi Európa Kulturális Fővárosa projekt kapcsán.A bolognai folyamat 10 éves felülvizsgálati konferenciáját 2010. március 11-12-én a két ország közösen rendezte meg Budapesten, illetve Bécsben mintegy negyven miniszter részvételével.2011 első félévében, a magyar EU-elnökség alkalmából a bécsi magyar képviseletek közös programsorozatot valósítanak meg, melynek középpontjában a magyar elnökség alatt elfogadandó Duna-stratégia és a Liszt-év állnak.